يتبع قسم التنظيم مراقبة شئون التطوير الإداري ويهدف القسم برفع مستوى الأداء الإداري لمراكز العمل بجامعة الكويت وذلك من خلال تطوير وتحديث الهياكل التنظيمية الحالية في ضوء الاحتياجات وعبء العمل. بالإضافة إلى دراسة تحديث وتطوير الدراسات التنظيمية وذلك حسب الأسس والمعايير العلمية والنظم واللوائح المتبعة.